最后，我想趁此机会，表明我的一点愿望，就是现任总统蒋先生，为国民大会内外所共同拥戴，其当选已不待投票而早可决定。副总统应与总统同属一政党，且应为总统候选人所提名，夙为民主国家之通例。此次国民党所提之总统、副总统候选人，当选既绝对有把握，则其他党派或无党派人士，自不必有任何陪选之举动；节省手续，尚属次要，明知无可能，也无必要，而故为点缀，似与实事求是之旨相违。最近闻青年党与民社党均有不参加竞选之表示；无党派人士，既无组织，更不必有所作为。……深信各党派和全体国大代表也会同此主张的。 
　　借了国民党预定调子的宣传，王云五似乎在幽幽地发泄牢骚。选举大会由王云五主持，一切都在预料之中，蒋介石、严家淦分别“当选”为“总统”、“副总统”。
　　对于王云五在“国大”上的表现，台湾方面有不同看法。国民党报纸把他吹捧为“国大之宝”、“最佳主席”、“说明专家”、“最佳风度代表”。在国民党的舆论专制时期，王云五在“国大”的表现是受到高度赞扬的，几乎听不到坦率的批评声。在70年代末台湾党禁稍有所松动的政治背景下，对王云五的评价有了些新意。朱文伯撰文指出，1960年“国大”第三次会议，执政党坚持“总统”不经“宪法”修改程序得以连任，遭到强烈抵制，以致多数国民党籍的代表也希望通过“修宪”，使“总统”的连任“有法可依”，代表们亦可行使创制、复决两权。争论的结果，“动员戡乱时期，总统、副总统得连选连任”，但又通过“国民大会制定办法，创制中央法律原则与复兴中央法律，不受宪法第二十七条第二项之限制”，王云五为之协调，并保证“本人来自工商界”，说话算数，“希望大家信任本人的说话”。但到了1966年第四次“国大”，王云五却食言了。朱文伯对王云五的食言与不敢秉公言政作了如下述评：
　　云五先生好象忘了六年前的“保证”，主席团也好，大会也好，他竟不坚持了。为了怕“得罪巨室”，说“一”不是“一”，说“二”不是“二”，不能不说是一种缺憾！……他不是三缄其口的人，对同胞，对公教人员，甚至对外国人，常有谈话发表，何以对政府吝于进言呢？
　　从1957年国民党八大到1969年国民党十大，是台湾当局借鼓吹“反攻复国”、大大强化一党专政的时期。王云五本人有在台湾担任“考试院”副院长和“行政院”副院长的经历，他在公开场合发表的言论，其政治倾向性是很明显的。他原本一些有限的民主意识，往往屈从于官方意旨，或者说服从于国民党的意旨，而很少体现出来。
　　1972年和1978年，台湾方面召开“国大”一届五次和六次大会。其时，王云五年老体衰，而且已脱离政坛多年，有时敢讲几句不合时宜的话，对徒具形式的“国民大会”不抱什么奢望，偶尔出席几次会议，无所重要表现。
　　奉命主持行政改革，提出改革建议案，涉及弊政方方面面。军方缺乏合作诚意，蒋介石放弃改革初旨，采取拖延策略。前后折腾九年多，王云五殚精竭虑，绩效甚微，反而激发民间怨气和讥评。
　　1954年8月王云五出任“考试院”副院长，1958年7月转任“行政院”副院长，至1963年12月辞去官职。在台9年为官任内，因为党内外有别的关系，他没有参与过国民党中央决策事宜。从无党派人士从政的角度看，王云五当官为国民党一党专政作了些许粉饰，主要起了政治点缀品的作用。但他本人想在官场有所作为，曾竭尽全力投入一桩“公事”，即主持设计行政改革方案，并勉力推行之，虽然客观效果不很显著，却是他从政生涯中值得一提的一段经历。
　　1954年10月，王云五受聘为“革命实践研究委员会科学管理专题研究组专题研究委员”。此后，他多次主持该组的座谈会，先后与各行政机关长官幕僚、公营和私营企业负责人商讨问题，听取意见，力图提出可供当局采行的改革方案，以提高行政效率。该研究组的宗旨，王云五在1955年主持第三次座谈会时，讲得很明白：
　　科学管理专题研究小组旨在研究党、政、军三方面密切联系，进而提高行政效率，使得彼此配合，以达到总统所号召的“科学方法，法制精神”的目的。近年来，政府在军事方面，因有美国顾问团之协助整顿，确有相当进步。政治方面虽也有进步，但仍不够理想。我们知道行政主要是在便民，但如许多机关公文旅行，费时甚久，有时往往石沉大海，不独对便民说不过去，就反攻动员方面来说，更是谈不上。
　　经过半年多的调查考察，王云五于1955年7月中旬，以“科学管理专题研究组”召集人的名义，向那时的兼任“行政院”院长的“总统”蒋介石提出改进行政效率研究报告，详细汇报调研过程、目前存在的问题并建议参考美国胡佛研究委员会的经验，实施行政改革。这份报告的最后部分写道：
　　今日行政方面病况已深；救治不容再缓。如欲实现院长所指示“简化办事手续，实行分层负责，严格考核成绩”各项，以达提高行政效率，配合党政军联合作战之目的，窃以为首应划分机关相互间与机关上下级间之职权，进而检讨如何减少公文表报，简化重复手续。……为七年之病，求三年之艾，似宜略仿美国政府设立胡佛委员会之意，超然于五院之外，成立一行政效率调查委员会，期以一年时间，完成调查研究工作，制成建议，直接呈报总统，以供采择施行。