１９１８年４月，孙科在广州任军政府外交部秘书。５月２１日，宋庆龄随孙中山离穗赴沪，协助孙中山完成《孙文学说》和《实业计划》两部光辉著作的撰写。这两部著作与《民权初步》合称为《建国方略》，是孙中山一生最重要最光辉的哲学著作，也凝聚着宋庆龄的心血。
    １９２０年１１月，宋庆龄随孙中山离沪返穗，再次建立军政府。孙科于次年２月，任军政府辖下广州特别市市长，推行新市政。５月，孙中山被选为中华民国非常大总统，宋庆龄仍任孙中山秘书工作。孙中山为巩固广东革命根据地，决定进驻广西，彻底消灭桂系，宋庆龄则在广州组织出征军人慰劳会，派妇女代表到广西前线慰劳。１２月，宋庆龄亲率红十字会会员由广州抵桂林，支援北伐，孙中山亲自迎接。宋庆龄在桂林始终参加孙中山与共产国际特派代表马林的三次会晤长谈，从而大大加深了对苏联和共产党的理解。
    １９２２年６月１６日，陈炯明在广州发动叛变，炮轰总统府，欲置孙中山于死地。在万分危急之中，宋庆龄临危不惧，再三要求孙中山先撤走，她说：“中国可以没有我，不可以没有你。”表现出献身革命事业的坚强意志和卓越胆识。６月１８日，宋庆龄与孙中山在黄埔相会后，旋按孙中山旨意先赴上海。８月９日，孙科随父孙中山一起回上海。在沪期间，宋庆龄陪同孙中山先后会晤了李大钊和苏联代表越飞等。
    ２月１５日，孙科随孙中山由沪返穗重建大元帅府，宋庆龄留沪处理要务，孙科复任广州市市长。５月２日，宋庆龄从上海回到广东。１０月孙科参加改组国民党工作，被孙中山委任为９人临时中央执行委员会成员。
    １９２４年１月２０日，孙中山在广州主持召开中国国民党第一次全国代表大会。孙科被指派为广州特别区代表出席了大会。大会通过了《中国国民党第一次全国代表大会宣言》，重新解释了三民主义，确立了联俄、联共、扶助农工三大政策。这次大会标志着第一次国共合作正式形成。宋庆龄、孙科在孙中山实现这伟大转变过程中始终同孙中山同心同德，互相支持，互相鼓励，功不可没。
    １９２４年１０月，爱国将领冯玉祥发动北京政变，旋即电邀孙中山北上主持国家统一大计。１１月，孙中山在宋庆龄的陪同下离开广州北上。孙中山由于长期为革命奔波，积劳成疾，抵达北京后病情加重，经协和医院手术确诊为肝癌。宋庆龄心如刀绞，日夜侍候于病榻旁，形容憔悴。随着孙中山病情日渐恶化，２月２２日服侍于孙中山病榻前的孙科等人请示孙中山立遗嘱。３月１１日，宋庆龄含泪用双手把着孙中山的手腕在国事遗嘱、家事遗嘱及《致苏联遗书》等三份遗嘱上签了字。
    ３月１１日下午，孙中山处于弥留之际，将孙科和戴恩赛叫到病榻前特别嘱咐他们要善待宋庆龄。孙中山如此牵挂宋庆龄，可见夫妻情深谊笃。
    ３月１２日９时３０分，孙中山与世长辞，举国哀悼，万民同悲。１５日，遗体施行防腐后入殓，宋庆龄在孙科等人陪同下参加入殓仪式。１９日，孙中山灵柩奉移中央公园内社稷坛大殿安放，先后前往吊唁、瞻仰者达七十六万多人。４月１２日，遗体移往北京香山碧云寺金刚宝塔的石龛之中，宋庆龄在孙科、陈淑英等人陪同下坚持守灵。
    遵孙中山嘱愿，４月１１日、２０日，宋庆龄带病与孙科、何香凝等人两次乘车到南京紫金山麓勘察墓地，并参加一系列的追悼活动和中山陵墓设计的评选工作。１９２６年３月１２日，宋庆龄与孙科等人参加了陵墓奠基礼。
（二）    孙中山逝世后，宋庆龄为维护孙中山的三大政策，贯彻孙中山的革命主张，实现孙中山的遗志而努力奋斗。１９２６年１月，她抱病从上海返穗参加中国国民党第二次全国代表大会，同中国共产党人紧密合作，对国民党右派进行了斗争。孙科也出席了这次大会。会上，宋庆龄当选为中央执行委员，孙科当选为中常委委员、中政会主席团成员、青年部部长、中央军委委员、国府常务委员。
    随着北伐战争的节节胜利，革命中心已由广州移至武汉，因此，国民党中央决定国民政府迁移武汉。１９２６年１１月１６日，宋庆龄与孙科等六十余人先行到武汉考察，作迁都的准备工作。途经南昌时，宋庆龄、孙科一行赶往庐山牯岭与蒋介石会谈，讨论迁都武汉等问题。１２月１３日，在武汉召开党政联席会议，决定宋庆龄、孙科、董必武、宋子文等１０人组成临时联席会议，作为迁都期间的临时党政最高权力机关。陈淑英亦随孙科携子女住武汉与宋庆龄亲密相处。
    １９２７年初，国民党中央政治会议决定设立武汉政治分会，由宋庆龄、孙科等１３人为委员。同年３月，国民党二届三中全会在汉口召开，宋庆龄与孙科、徐谦等５人被选为大会主席团成员。会议重申孙中山三大政策和坚持国共合作统一战线的基本原则，并通过了旨在反对蒋介石军事独裁，提高党权的决议。会上，宋庆龄被选为国民党中央政治委员会委员、国民政府委员。孙科当选为武汉国民政府常委、交通部部长等职。