在目前的情况下，进一步揭示还原论思维方式的局限性，促进复杂性科学的发展，以达到在科学方法论上对还原论的超越是非常必要的。当然，这种超越不是简单地否定和抛弃还原论。Bunge曾给出一句妙言，他说，在科学中“完全拒斥还原将使我们丧失理解事物过程的乐趣，并丧失（还原论）知识赋于我们的能力”。完全排斥还原论就意味着保持对整体各组成部分的无知。这样，整体就会由于缺乏对细节了解而成为打不开的黑箱。 

　　在目前的出版物中，对还原论的批判大多出现在对系统论的宣扬与阐述中。但批判的武器不能代替武器的批判。近年由上海世纪出版集团出版的《还原论的局限——来自活细胞的训诫》（Lessons from the living cell：The limits of reductionism）一书对此作了比较深入的探讨。本书作者斯蒂芬·罗思曼是哈佛大学医学院的细胞生物学教授，40多年来在蛋白质分子膜转运的细胞分子机理（此领域研究被授1999年度诺贝尔医学奖，获奖人为洛克菲勒大学的细胞分子学家布洛贝尔）方面作出许多重要发现，他以自己的研究工作揭示了生物还原论在解释生命（活细胞）现象方面的局限。作者是一位具有哲学修养的生物学家，对生物还原论的研究方法一直采取批判的态度。该书对还原论的多种含义和实验纲领作了比较系统的介绍，可供对生物还原论有兴趣的读者学习使用，同时对进行复杂性科学研究的科学家也有一定的参考价值。