全书分上下两篇，上篇为总论，介绍肠道微生物研究现状与进展、细菌学、细菌生理功能 、 肠道屏障生理功能和屏障功能障碍、肠道细菌生态平衡和生态失调、细菌诊断、肠道微生物与食物消化和营养吸收、肠道微生物与药物代谢、肠道微生物与免疫、肠道微生物与炎症。下篇为肠道微生物与消化系统疾病和肿瘤各论 ，分别详尽介绍肠道微生物与胃肠、肝胆胰疾病和消化系肿瘤的相关性的研究现状和诊治。

上篇总论
第１章肠道微生物与消化系统疾病相关研究现状与进展
第1节概述
第2节肠道微生物与系统疾病
第3节肠道共生菌的免疫调节功能
第4节孕烷X受体在调节细菌易位中的作用
第5节肠道菌群失调诊治的现状
第6节结语
第２章肠道微生物
第1节微生物与人体的相互作用
第2节肠道微生物的组成
第3节肠道微生物的生理
第4节肠道微生态平衡
第5节肠道微生物研究方法与方向
第３章肠道微生物与食物消化和营养吸收
第1节肠道微生物对摄入食物的代谢
第2节食物摄入对肠道微生物代谢的影响
第４章肠道微生物与药物代

上篇总论
第１章肠道微生物与消化系统疾病相关研究现状与进展
第1节概述
第2节肠道微生物与系统疾病
第3节肠道共生菌的免疫调节功能
第4节孕烷X受体在调节细菌易位中的作用
第5节肠道菌群失调诊治的现状
第6节结语
第２章肠道微生物
第1节微生物与人体的相互作用
第2节肠道微生物的组成
第3节肠道微生物的生理
第4节肠道微生态平衡
第5节肠道微生物研究方法与方向
第３章肠道微生物与食物消化和营养吸收
第1节肠道微生物对摄入食物的代谢
第2节食物摄入对肠道微生物代谢的影响
第４章肠道微生物与药物代谢
第1节肠道微生物与药物代谢酶
第2节肠道微生物影响药物代谢机制
第５章肠道微生物与免疫
第1节概述
第2节肠道微生物与先天免疫
第3节肠道微生物与适应免疫
第4节肠道微生物与肝脏自身免疫
第5节肠道微生物与肠黏膜屏障
第6节微生物来源的全身免疫应答的机制
第６章肠道细菌内毒素血症
第1节肠道微环境
第2节肠道微生物群与败血症和脓毒血症
第７章肠道微生物与炎症
第1节肠道微生物群和免疫反应
第2节炎症对肠道微生物群落结构的影响
第８章肠道微生物失调（生态失衡）
第1节微生物失调的概念与分类
第2节诱发因素
第3节临床表现
第4节诊断
第5节防治
第９章中医学对肠道微生物与消化系统疾病的研究与应用
第1节中医对肠道微生态的认识
第2节中医药通过影响肠道微生物治疗消化道疾病的临床应用
第3节中医药通过影响肠道微生物治疗消化道疾病的实验研究

下篇各论
第１０章肠道微生物与炎症性肠病
第1节炎症性肠病的肠道菌群变化
第2节肠道菌群失调导致炎症性肠病的机制
第3节调节肠道菌群在炎症性肠病治疗中的作用
第１１章肠道微生物与肠易激综合征
第1节概述
第2节肠道菌群失调与肠易激综合征
第3节治疗
第１２章肠道微生物与功能性消化不良
第1节概述
第2节肠道微生物参与功能性消化不良的发病机制
第3节功能性消化不良的临床表现和诊断标准
第4节功能性消化不良的治疗
第１３章肠道微生物与功能性腹痛
第1节功能性腹痛/中枢介导的腹痛综合征
第2节中枢介导的腹痛综合征与肠易激综合征
第3节功能性胃肠病及功能性腹痛综合征发生机制及其与肠道微生物的关系
第4节诊疗
第１４章肠道微生物与非酒精性脂肪性肝病
第1节概述
第2节肠道微生物引起非酒精性脂肪性肝病的发病机制
第3节肠道微生物与非酒精性脂肪性肝炎
第4节调整肠道菌群在非酒精性脂肪性肝病治疗中的应用
第5节结语
第１５章肠道微生物与酒精性肝病
第1节概述
第2节发病机制
第3节酒精性肝病患者肠道微生物的变化
第4节治疗
第１６章肠道微生物与病毒性肝炎
第1节肠道微生物与慢性病毒性肝炎
第2节肠道微生物与肝炎病毒引起的肝衰竭
第１７章肠道微生物与肝硬化
第1节肠道微生物与肝硬化研究简史
第2节肠肝轴
第3节肠道微生物与宿主代谢
第4节肝硬化与肠道微生物改变
第5节肠道微生物与肝硬化并发症
第6节重建肠道微生物平衡
第１８章肠道微生物与自身免疫性肝炎
第1节概述
第2节流行病学
第3节肠道微生物在自身免疫性肝炎发病机制中的作用
第4节分型与诊断
第5节肠道微生物群治疗
第１９章肠道微生物与原发性胆汁性胆管炎
第1节概述
第2节肠道微生物与原发性胆汁性胆管炎发病的关系
第3节肠道微生物在原发性胆汁性胆管炎治疗中的作用
第２０章肠道微生物与胰腺炎
第1节概述
第2节胰腺微生物群
第3节肠道屏障功能障碍与胰腺炎
第4节急性坏死性胰腺炎时肠道微生物群的生态失调
第5节慢性胰腺炎患者肠道微生物群的生态失调
第２１章肠道微生物与胆囊炎及胆石症
第1节肠道微生物与胆石症
第2节肠道微生物与胆囊炎
第２２章肠道微生物与肝性脑病
第1节肝性脑病发病机制
第2节针对肠道微生物对肝性脑病的治疗
第3节结语
第２３章肠道微生物与食管癌
第1节正常食管微生物群
第2节微生物与食管癌
第3节微生物在食管癌发病中的潜在作用
第4节微生物影响抗肿瘤药物的作用
第5节展望
第２４章肠道微生物与胃癌
第1节概述
第2节胃微生态
第3节幽门螺杆菌与胃癌
第4节其他胃微生物与胃癌
第5节胃癌的治疗
第6节展望
第２５章肠道微生物与结直肠癌
第1节概述
第2节肠道微生物导致结直肠癌机制的研究现状与进展
第3节益生菌和益生元与结直肠癌
第4节结论
第２６章肠
……

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